内分泌代謝科では、メタボリックシンドロームの主体をなす糖尿病を中心に診療しております。１～２週間の糖尿病教育入院をクリニカルパスに基づいて行っており、医師、看護師、栄養士、薬剤師、理学療法士が協力して、きめ細かな教育、指導を行っています。

合併症についても、眼科等他科と協力して早期発見、治療に努めていますが、トレッドミルにて狭心症の疑いがあれば心臓カテーテル検査を行ったり、睡眠時無呼吸症候群（SAS）の疑いがあれば、ポリソムノグラフィーを施行し適切に鼻マスク陽圧呼吸（CPAP）療法の導入を行うことも、当院の大きな特徴です。

特にSASは、睡眠の質を低下させ、肥満をベースとして循環器疾患や内分泌代謝疾患などのメタボリックシンドロームの増悪因子であることが知られています。当院では平成12年からその診療に積極的に取り組み、既に患者数は5000名を超え、CPAP療法を他のメタボリックシンドロームの治療に積極的に組み入れており、患者さまからも評価していただいております。

糖尿病以外の内分泌疾患（甲状腺、副甲状腺、副腎、下垂体疾患）についても、各種内分泌負荷試験にて診断を行い、女性に多い甲状腺結節についてはエコーガイド下の吸引細胞診を行っています。必要な場合は、泌尿器科、外科などとも協力して治療にあたっています。